Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms