Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms