Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SsbP32067 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SsbP32067 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SsbP32067 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SsbP32067 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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