Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms