Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col2a1P28481 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms