Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aco1P28271 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms