Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms