Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtcP11725 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtcP11725 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OtcP11725 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OtcP11725 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OtcP11725 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OtcP11725 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms