Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hcn1O88704 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hcn1O88704 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms