Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20830J3KML6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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