Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
R3hdm1E9Q9Q2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms