Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms