Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pramef6A2A8M8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pramef6A2A8M8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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