Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms