Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx1Q9WV80 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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