Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ArcQ9WV31 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ArcQ9WV31 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms