Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms