Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNIH4Q9P003 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNIH4Q9P003 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNIH4Q9P003 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNIH4Q9P003 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms