Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms