Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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