Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nop56Q9D6Z1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nop56Q9D6Z1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nop56Q9D6Z1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nop56Q9D6Z1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nop56Q9D6Z1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nop56Q9D6Z1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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