Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spns3Q9D232 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms