Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Cnih4Q9CX13 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Cnih4Q9CX13 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Cnih4Q9CX13 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cnih4Q9CX13 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Cnih4Q9CX13 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cnih4Q9CX13 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cnih4Q9CX13 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cnih4Q9CX13 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cnih4Q9CX13 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cnih4Q9CX13 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cnih4Q9CX13 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cnih4Q9CX13 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih4Q9CX13 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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