Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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