Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brms1Q99N20 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms