Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms