Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trub2Q91WG3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms