Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM5

Myocd, Myocardin, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyocdQ8VIM5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms