Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd1Q8VCZ8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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