Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Vmn1r200Q8R281 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Vmn1r200Q8R281 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Vmn1r200Q8R281 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Vmn1r200Q8R281 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Vmn1r200Q8R281 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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