Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn7l2Q8C8K6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atxn7l2Q8C8K6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atxn7l2Q8C8K6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atxn7l2Q8C8K6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atxn7l2Q8C8K6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atxn7l2Q8C8K6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atxn7l2Q8C8K6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn7l2Q8C8K6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms