Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcal1Q8BJL0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms