Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.6Q85ZW5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms