Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms