Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms