Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms