Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms