Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig3P97386 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms