Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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