Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms