Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gabra1P62812 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms