Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2fP61219 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms