Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms