Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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