Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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