Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms