Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc6a9P28571 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms