Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf8P23611 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms