Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms