Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01665 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01665 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01665 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01665 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01665 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01665 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01665 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01665 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01665 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01665 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01665 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms